真菌是环境中常见的一种真核微生物，它常常定于人类皮肤及黏膜，可以不引起免疫反应，在人类免疫系统功能正常时可与人类共存，然而在免疫功能损伤、人类宿主的屏障被破坏的时候，真菌便可以侵犯人体引起真菌感染。与其他微生物感染相比，在临床中对真菌感染的认识较浅、诊断的方法不多、大多数患者不能得到早期诊治。
近些年由于自然、社会环境不断地发生变化，主要致病真菌病原谱在不断地改变，除了常见的真菌感染，许多之前没有致病性的环境真菌发生了进化、变异，成为了致病真菌，甚至成为了多重耐药的强致病菌。此种强致病菌对大多常用抗真菌药物耐药，且确诊困难，在医院相关场所存活时间长，传播范围广，可引起暴发式感染，使其成为世界范围内诊断与治疗的难点。
详细情况 |
侵袭性真菌感染是导致危重病患者死亡的主要疾病之一，在美国及许多发达国家位居医院血源性感染的第四位，许多医疗权威人士估计由其导致的成人死亡率为15-25，侵袭性曲霉病病死率高达50%。同时抗真菌药物作用于真菌菌体的同时也容易对人体细胞产生毒副作用，临床治疗真菌感染的药物有限、用药剂量较大、疗程长、因此不良反应多、毒性较大，成为临床应用抗真菌药物的主要瓶颈。
组织病理学检查及微生物培养是真菌感染疾病的传统与直接的检测方法，但是有下列缺点：
(1) 如果获取的标本来自非无菌部位，则不能区分真菌污染、定植和感染，不能将其作
为确诊的依据；如果以侵入性检查从无菌部位获取待测样本，则普通病人配合度低，重症病人实施操作难度高；
(2) 培养需要较长时间，需要多次培养，部分镜下检验需要由经验丰富的检验人员操作；虽然新型培养基、自动化血培养系统能降低微生物培养时间，但没有明确证据证明此类新进展能提升诊断敏感性；
(3) 组织病理学检查也是常用的诊断方法，但也缺乏敏感性和精确性，例如一种菌种，在镜下会呈现不同形态。当需要根据菌种选择药物，将曲霉与其他真菌区分时，组织病理学结果常会出现问题。
侵袭性真菌感染血清学检测主要有两种，第一种为抗原检测，有G实验、GM实验、Mn(念珠菌甘露聚糖)实验、GXM(隐球菌荚膜多糖)实验等；第二种为抗体检测，有特异性IgM、IgG抗体检测，但是有下列缺点：
(1) 葡聚糖等成分分布于环境中各个位置，因此血清学检测易出现假阳性结果；
(2) 不能精确地鉴定菌种；
(3) 此法不能检验隐球菌和接合菌的感染，因为它们葡聚糖含量很少；
(4) 不同循环抗原与抗体之间可能有交叉反应；
(5) 由于抗真菌治疗会导致真菌细胞壁释放更少的半乳甘露聚糖，因此对于经验性抗真菌治疗的患者GM实验没有普通患者准确。
传统方法在早期诊断，快速诊断，精准诊断中都有着各种劣势。早期快速诊断能够尽早地展开针对性的临床治疗，无论是痰培养，组织病理，真菌抗原，还是抗体检测，DNA检测，都不能确定菌种，定量测定，实现耐药性检测等，进而影响患者的预后，现今新型分子诊断技术不断出现，为临床诊断提供了新的机会与帮助。
核酸诊断如PCR，恒温扩增具有特异性高、灵敏度高、检测时间短等特点，与镜下检查、血液标本检查的方法相比，核酸诊断的结果更迅速、更准确，是真菌感染诊断新的强力助手。因为核酸检测灵敏度高，结果准确，可以使用临床样本试验区别感染和定殖，还能连续监测用药的结果使识别之前难以培养鉴定的真菌变成可能，还可以进行耐药性及其他快速测定，是未来具有很大前景的技术手段。
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